Vienintelė rimta komanda, kuri tinka šiam reikalui, tai:
# emerge --depclean
"emerge --prune", kaip siūlė administratorius, praktiškai pražudys tavo sistemą, ko pasekoje, be:
# emerge -e world
neišsiversi... "--prune" naudinga tik kartu su "--pretend", tai yra:
# emerge -pP
tai parodys dubliuotus skirtingų versijų paketus... Iš čia gauto rezultato, gali tik pažiūrėti ir pats (emerge -C =sys-kernel/gentoo-sources-versija) išdiegti nebereikalingus branduolio išeities tekstus (senąją versiją, jei susikompiliavai naują, o taip pat nepanaudotas tarpines versijas, jei tokių buvo). Visi kiti paketa yra reikalingi, kadangi skirtingi paketai naudoja sąraše pateiktų paketų skirtingas versijas.